年引起临床感染的新分离细菌
张*民
[梅里埃诊断产品（上海）有限公司，上海]
关键词：新分离细菌；感染；年
年全球共报告与临床感染相关的新命名细菌包括亚种共19种，现简要介绍如下。
1葡萄球菌
1.1银色葡萄球菌
（Staphylococcusargenteus）
该菌于年9月从医院的一例55岁女性患者血培养中分离。患者诊断为坏死性筋膜炎。当时根据基因组学及表型特征（如试管法凝固酶试验阳性）鉴定为金*色葡萄球菌。但与典型金*色葡萄球菌比较，该菌缺乏产葡萄球菌*素基因，产生的色素不是金*色，而是类胡萝卜素色素。多位点序列分型（multi-locussequencetyping，MLST）和单基因组序列与金*色葡萄球菌明显不同。TONG等[1]对MLST的5株MSHR型菌（来自临床标本）和株FSA型菌（来自非临床标本）进行全基因组、质谱、表型等检测，有充分理由将这些与金*色葡萄球菌相近的菌命名为葡萄球菌属的新种，分别是银色葡萄球菌和施韦泽葡萄球菌（Staphylococcusschweitzeri）。后者来自非临床标本，不在此介绍。
银色葡萄球菌因试管法凝固酶阳性而易鉴定为金*色葡萄球菌，表1为VITEKGP卡的试验，可供鉴别参考。
1.2彼特拉斯葡萄球菌布拉格亚种
（Staphylococcuspetrasiisubsp.pragensis）
SVEC等[2]对—年分离的7株凝固酶阴性、新生霉素敏感菌进行分类研究。其中6株来自捷克的临床标本[1]株来自前列腺炎患者的分泌物、1株来自阑尾脓液、2株来自伤口脓液（分别是手感染和蜂窝织炎患者）、2株来自血培养（分别是胰腺炎和脓*血症患者）]、1株来自比利时的啤酒厂空气。所有7株菌用rep-PCR指纹图分析，属于葡萄球菌属。用16SrRNA基因、hsp60、rpoB、dnaJ、gap和tuf序列分析，与彼特拉斯葡萄球菌相近，但又与彼特拉斯葡萄球菌已有的3个亚种（彼特拉斯葡萄球菌*色溶细胞亚种、彼特拉斯葡萄球菌热特亚种、彼特拉斯葡萄球菌彼特拉斯亚种）不同。进一步用自动核糖体基因分型、质谱、DNA-DNA杂交等研究，确认为彼特拉斯葡萄球菌的新亚种，由于这6株菌来自捷克的临床标本，其中3株从布拉格分离，因此命名为彼特拉斯葡萄球菌布拉格亚种。见表2。
2曼彻斯特居咽菌
(Faucicolamancuniensis)
该菌是HUMPHREYS等[3]于年在一次健康人群口咽菌群调查中，从一名健康成年女性的扁桃体分离，其临床意义目前尚不清楚。初代培养是在马丁培养基（含万古霉素、黏菌素和制霉菌素）上37℃需氧环境中培养5d。传代培养是在含5%脱纤维羊血的哥伦比亚琼脂37℃环境中培养2d。革兰染色为阴性球菌，触酶、氧化酶均阳性，水解DNA。近全长16SrRNA基因序列分析与鲍氏莫拉菌（Moraxellaboevrei）（ATCC）最相似（94.68%）。表型生化反应与莫拉菌属中的其他菌类似，但水解D-葡萄糖、密二糖、L-阿拉伯糖、鼠李糖产弱酸且能水解DNA又与莫拉菌属不同。该菌的表型和系统进化分析与莫拉菌科其他属不同，是莫拉菌科的新菌属，由于是从人的咽部分离的，故属名为居咽菌属（Faucicola），种名则以首先分离的城市英国曼彻斯特命名，即曼彻斯特居咽菌。
3肠杆菌科
3.1巴斯德柠檬酸杆菌（Citrobacterpasteurii）
伴随新分类技术的应用，以往用传统方法分类命名的菌种，部分会重新被分类和命名。巴斯德柠檬酸杆菌就是其中之一。法国巴斯德研究所的CLERMONT等[4]采用多位点序列分析（multilocussequenceanalysis，MLSA）对保存的86株柠檬酸杆菌进行系统发育结构研究。其中编号为CIP55.13和CIP55.9的菌株与杨氏柠檬酸杆菌（Citrobacteryoungae）相似（99.19%）,但表型特征如尿素酶、β-葡萄糖苷酶阳性，触酶、鸟氨酸脱羧酶阴性以及分解淀粉和七叶苷产酸又与杨氏柠檬酸杆菌不同，建议将这株菌命名为柠檬酸杆菌的一个新种。由于菌株保存在巴斯德研究所，因此命名为巴斯德柠檬酸杆菌。该菌主要引起腹泻。编号CIP55.13，于年从美国的一名腹泻患者中分离。
3.2自由伴生菌（Sodalispraecaptivus）
肠杆菌科目前有42个属，其中伴生菌属（Sodalis）于年被报道。因在舌蝇细胞内才能生长，因此该属第个菌种命名为舌蝇伴生菌（Sodalisglossinidius）。由于需在细胞内生长，菌种分离培养非常困难，曾将其归入一个特殊类别“Candidatus”，即候选类。目前已有特殊培养基能成功分离培养该菌。年CLAYTON等[5]报道了一株从一名美国71岁患者手部伤口渗液分离的菌。患者手被山楂树叉刺伤引起感染。CHARI等[6]根据16SrRNA基因序列分析和基因组比较发现，该菌与舌蝇伴生菌及伴生菌属的其他菌关系密切，但可以在培养基上生长，认为是伴生菌属的一个新种。由于该菌不需要与昆虫共生，可在培养基上生长，因此命名为自由伴生菌。可在LB琼脂或肉汤、麦康凯琼脂、哥伦比亚血琼脂等培养基25～37℃培养生长。
3.3萨尼奇塔特姆菌（Tatumellasaanichensis）
年1月在加拿大不列颠哥伦比亚省，从一例患囊性纤维化的男青年痰标本中分离出一种不常见的革兰阴性杆菌，编号NML06-，送至温哥华以及国家微生物参考实验室鉴定。TRACZ等[7]采用全基因组测序、蛋白组学、表型试验、电镜、化学分类学以及临床调查等对该菌株进行了全面研究。全基因组测序分析和MLSA显示，该菌与痰塔特姆菌（ATCC）相近，通过16SrRNA基因测序，与痰塔特姆菌（ATCC）序列98.7%相同。用质谱分析显示，与痰塔特姆菌（ATCC）仅在属水平匹配，种水平不匹配。鸟枪法蛋白组学研究显示，NML06-菌株与痰塔特姆菌（ATCC）各自具有独特的基因组。综合以上研究认为NML06-菌株是塔特姆菌属的一个新种，因整个研究是在加拿大温哥华的萨尼奇市进行，因此命名为萨尼奇塔特姆菌。
塔特姆菌属目前有6个种，其中4个种从食品和环境分离，2个种与临床相关，即痰塔特姆菌和萨尼奇塔特姆菌。痰塔特姆菌年被报道，68%从呼吸道标本（痰、咽部）分离，少数从血、尿标本分离。自年首次被报道后，仅年有该菌引起临床感染的报道。萨尼奇塔特姆菌也分离自囊性纤维化患者痰标本，但分解乳糖，VP试验、七叶苷水解试验阴性，不分解水杨素、蔗糖、海藻糖，可与痰塔特姆菌区别。
4非发酵菌
4.1塞弗特不动杆菌（Acinetobacterseifertii）
年GERNER-SMIDT等建议将表型相似的不动杆菌作为一个群，即鲍曼不动杆菌复合群（Acinetobacterbaumannii