安徽中医药大学共有10个学院（医院）的个研究方向招收在临床医学方面被推荐免试读研的优秀应届本科毕业生。具体专业和研究方向目录如下：
1、中医学院、中医基础理论专业，新安医学特色理论研究与应用方向；
2、中医学院、中医基础理论专业，中医治则治法研究与应用方向；
3、中医学院、中医基础理论专业，经脉、藏象理论研究与应用方向；
4、中医学院、中医临床基础专业，《伤寒论》《金匮要略》《温病学》证治规律、治则治法及方药研究方向；
5、中医学院、中医临床基础专业，新安医派中有关仲景学说及外感病理论与临床特色研究方向；
6、中医学院、中医临床基础专业，历代医家学术思想与临床经验研究方向；
7、中医学院、中医医史文献专业，中医古代与近现代史学研究方向；
8、中医学院、中医医史文献专业，中医古籍整理研究方向；
9、中医学院、中医医史文献专业，新安医学流派研究方向；
10、中医学院、方剂学专业，方剂的文献与组方理论研究方向；
11、中医学院、方剂学专业，方剂的配伍规律研究方向；
12、中医学院、方剂学专业，方剂的物质基础与方效机制研究方向；
13、中医学院、中医诊断学专业，证候微观化及其机制研究方向；
14、中医学院、中医诊断学专业，证候规范化标准化研究方向；
15、中医学院、中医诊断学专业，四诊信息化及客观化研究方向；
16、针灸推拿学院（康复医学院）、针灸推拿学专业，腧穴主治规律及作用机理研究方向；
17、针灸推拿学院（康复医学院）、针灸推拿学专业，经脉-脏腑相关研究方向；
18、针灸推拿学院（康复医学院）、针灸推拿学专业，针灸临床作用机制及应用技术研究方向；
19、针灸推拿学院（康复医学院）、针灸推拿学专业，灸法临床应用及其机制研究方向；
20、针灸推拿学院（康复医学院）、针灸推拿学专业，推拿基础与临床研究方向；
21、中西医结合学院（生命科学学院）、中西医结合基础专业，腧穴配伍效应规律与中枢整合机制研究方向；
22、中西医结合学院（生命科学学院）、中西医结合基础专业，神经系统疾病中西医结合基础与临床研究方向；
23、中西医结合学院（生命科学学院）、中西医结合基础专业，疾病系统生物学机制与中医药干预研究方向；
24、中西医结合学院（生命科学学院）、中西医结合基础专业，慢性病中西医结合治疗与健康干预研究方向；
25、中西医结合学院（生命科学学院）、微生物与生化药学专业，抗真菌感染药物研究与开发方向；
26、中西医结合学院（生命科学学院）、微生物与生化药学专业，抗细菌生物膜药物研究与开发方向；
27、中西医结合学院（生命科学学院）、微生物与生化药学专业，肿瘤生化与药物干预研究方向；
28、中西医结合学院（生命科学学院）、微生物与生化药学专业，肠道菌群失衡相关疾病的药物干预研究方向；
29、中西医结合学院（生命科学学院）、微生物与生化药学专业，病原微生物耐药与致病机制研究方向；
30、中西医结合学院（生命科学学院）、药理学专业，心血管药理学方向；
31、中西医结合学院（生命科学学院）、药理学专业，肿瘤药理学方向；
32、中西医结合学院（生命科学学院）、药理学专业，代谢药理学方向；
33、中西医结合学院（生命科学学院）、药理学专业，生殖与内分泌药理学方向；
34、药学院、药物化学专业，药物设计及合成工艺研究方向；
35、药学院、药物化学专业，天然药物活性成分现代分离技术方向；
36、药学院、药物化学专业，天然药物活性成分结构修饰与改造方向；
37、药学院、药物化学专业，制药过程传质与分离方向；
38、药学院、药剂学专业，药物制剂新技术新剂型研究方向；
39、药学院、药剂学专业，中药新制剂新工艺研究方向；
40、药学院、药剂学专业，生物技术药物新剂型新工艺研究方向；
41、药学院、药剂学专业，缓释控释制剂与生物药剂学研究方向；
42、药学院、药剂学专业，临床药剂学研究方向；
43、药学院、药剂学专业，天然药物与制剂药代动力学研究方向；
44、药学院、生药学专业，中药与生态环境相关性及生物技术研究方向；
45、药学院、生药学专业，药用植物生态、结构与质量研究方向；
46、药学院、生药学专业，中药资源与质量分析研究方向；
47、药学院、生药学专业，中药物质基础研究与新药开发方向；
48、药学院、药物分析学专业，药物质量控制与评价方向；
49、药学院、药物分析学专业，药物作用有效性与活性成分相关性研究方向；
50、药学院、药物分析学专业，药物分析新技术和方法研究方向；
51、药学院、微生物与生化药学专业，生物体活性成分及作用机制研究方向；
52、药学院、微生物与生化药学专业，生物合成与生物转化方向；
53、药学院、微生物与生化药学专业，作用于细菌生物膜药物的研究与开发方向；
54、药学院、药理学专业，心血管药理学方向；
55、药学院、药理学专业，肿瘤药理学方向；
56、药学院、药理学专业，内分泌及代谢药理学方向；
57、药学院、药物代谢动力学专业，中药及天然药物药代动力学研究方向；
58、药学院、药物代谢动力学专业，化学药物、生物药药代动力学研究方向；
59、药学院、药物代谢动力学专业，新制剂（缓、控释制剂）药代动力学研究方向；
60、药学院、药物代谢动力学专业，临床药物代谢动力学研究方向；
61、药学院、中药学专业，中药资源方向；
62、药学院、中药学专业，中药化学方向；
63、药学院、中药学专业，中药炮制方向；
64、药学院、中药学专业，中药药剂方向；
65、药学院、中药学专业，中药药理方向；
66、药学院、中药学专业，中药分析方向；
67、药学院、中药学专业，中药药代动力学方向；
68、药学院、药学(专业学位)专业，新药研究与开发方向；
69、药学院、药学(专业学位)专业，药品生产与检验方向；
70、药学院、药学(专业学位)专业，临床药学方向；
71、药学院、药学(专业学位)专业，药事管理与企业管理方向；
72、药学院、中药学(专业学位)专业，药用植物资源保护与利用方向；
73、药学院、中药学(专业学位)专业，中药加工与提取分离方向；
74、药学院、中药学(专业学位)专业，中药制剂与生产方向；
75、药学院、中药学(专业学位)专业，中药质量评价与控制方向；
76、药学院、中药学(专业学位)专业，中药新药研究与开发方向；
77、药学院、中药学(专业学位)专业，中药药事与企业管理方向；
78、医药信息工程学院（网络信息中心）、中医药信息学专业，磁共振功能成像数据分析与挖掘研究方向；
79、医药信息工程学院（网络信息中心）、中医药信息学专业，图像识别技术在医药领域的应用研究方向；
80、医药信息工程学院（网络信息中心）、中医药信息学专业，基于人工智能的药物相互作用关系研究方向；
81、护理学院、中医护理学专业，护理管理研究方向；
82、护理学院、中医护理学专业，护理教育研究方向；
83、护理学院、中医护理学专业，中医护理理论研究方向；
84、护理学院、中医护理学专业，临床护理研究方向；
85、护理学院、护理(专业学位)专业，内科护理方向；
86、护理学院、护理(专业学位)专业，外科护理方向；
87、护理学院、护理(专业学位)专业，妇产科护理方向；
88、护理学院、护理(专业学位)专业，儿科护理方向；
89、护理学院、护理(专业学位)专业，危重症护理方向；
90、护理学院、护理(专业学位)专业，社区护理方向；
91、护理学院、护理(专业学位)专业，护理教育方向；
92、人文与国际教育交流学院（外事办、港澳台办）、中医文化学专业，新安医学文化传承与创新研究方向；
93、人文与国际教育交流学院（外事办、港澳台办）、中医文化学专业，中医药健康养生文化研究方向；
94、人文与国际教育交流学院（外事办、港澳台办）、中医文化学专业，中医药文化传播研究方向；
95、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治老年病研究方向；
96、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治呼吸病研究方向；
97、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治心血管病研究方向；
98、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治肾病研究方向；
99、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治脾胃病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治内分泌疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治风湿病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治传染病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治危急重症研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学专业，中医药防治生殖障碍及男科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治外科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治肛肠疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治皮肤疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治乳腺疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医外治和外用药物研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治神经外科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学专业，中医药防治泌尿外科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，中医药促进骨折愈合的临床与实验研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，中医药防治软组织损伤的临床与实验研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，中医药防治颈肩、腰腿疼痛的临床与实验研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，脊柱脊髓病的研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，骨关节疾病的研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，创伤整复研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，骨显微外科临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学专业，手部创伤的研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、针灸推拿学专业，推拿（含小儿推拿）的临床应用及机理研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，锥体外系疾病（肝豆状核变性、帕金森病）临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，脑血管病临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，认知障碍及神经变性病的临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，睡眠障碍临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，中西医结合防治肾脏疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，中西医结合防治恶性肿瘤研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，中西医结合防治危重症临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床专业，中西医结合防治呼吸疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治老年病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治呼吸病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治心血管病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治脾胃病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治内分泌疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治风湿病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治传染病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治危急重症研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治生殖障碍及男科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治肾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学(专业学位)专业，中医药防治外科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学(专业学位)专业，中医药防治肛肠疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学(专业学位)专业，中医药防治皮肤疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学(专业学位)专业，中医药防治乳腺疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医外科学(专业学位)专业，中医外治和外用药物研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药促进骨折愈合的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药防治软组织损伤的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药防治颈肩、腰腿疼痛的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，脊柱脊髓病的研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，骨关节疾病的研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，创伤整复研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医妇科学(专业学位)专业，中医药防治不孕、不育研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医妇科学(专业学位)专业，中医药防治女性生殖内分泌疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医妇科学(专业学位)专业，中医药防治女性生殖系统炎症研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医儿科学(专业学位)专业，中医药诊治哮喘研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医儿科学(专业学位)专业，中医药诊治肾脏病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医五官科学(专业学位)专业，中医药治疗鼻科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医五官科学(专业学位)专业，中医药治疗耳科疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中医五官科学(专业学位)专业，中医药治疗咽喉病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、针灸推拿学(专业学位)专业，推拿（含小儿推拿）临床应用及机理研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，锥体外系疾病（肝豆状核变性、帕金森病）的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，脑血管病的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，认知障碍及神经变性病的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，睡眠障碍的临床研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，中西医结合防治肾脏疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，中西医结合防治恶性肿瘤研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，中西医结合防治危重症临床与基础研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、中西医结合临床(专业学位)专业，中西医结合防治呼吸疾病研究方向；
、第一临床医学院（第一医院、医院）、全科医学（中医，不授博士学位）(专业学位)专业，社区及乡镇卫生服务中心各种常见病、多发病及慢性病的治疗、管理及中医药研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治脾胃病研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治内科急症研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治心血管病研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医内科学(专业学位)专业，中医药防治肿瘤研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药促进骨折愈合的临床与实验研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药防治软组织损伤的临床与实验研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，中医药防治颈肩、腰腿疼痛的临床与实验研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，骨关节疾病的研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、中医骨伤科学(专业学位)专业，脊柱脊髓病的研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、针灸推拿学(专业学位)专业，针灸临床应用研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、针灸推拿学(专业学位)专业，推拿临床应用研究方向；
、第二临床医学院（第二医院、医院）、针灸推拿学(专业学位)专业，小儿推拿的临床应用及机理研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，肝豆状核变性中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，帕金森病及运动障碍疾病中西医结合研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，癫痫中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，脑血管病中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，神经免疫性疾病中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，肌病中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，认知障碍、睡眠障碍中西医结合临床基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床专业，神经康复的中西医结合临床与基础研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，肝豆状核变性中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，帕金森病及运动障碍疾病中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，癫痫中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，脑血管病中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，神经免疫性疾病中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，肌病中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，认知障碍、睡眠障碍中西医结合临床研究方向；
、第三临床医学院（第三医院、医院、神经病学研究所）、中西医结合临床(专业学位)专业，神经康复的中西医结合临床研究方向。